Kazuya Kujou es un estudiante extranjero en la Academia Saint Marguerite, un lujoso internado en el país de Sauville, en el sur de Europa. Originario de Japón, su cabello negro azabache y sus ojos castaños oscuros hacen que sus compañeros lo rechacen y le den el sobrenombre de "Black Reaper", basado en una leyenda urbana popular sobre el viajero que trae la muerte en primavera. Un día como cualquier otro, Kujou visita la extravagante biblioteca de la escuela en busca de historias de fantasmas. Sin embargo, su enfoque pronto cambia cuando siente curiosidad por un mechón de cabello dorado en las escaleras. Los escalones lo llevan a un gran jardín y a una hermosa niña parecida a una muñeca conocida como Victorique de Blois, cuya compleja e imaginativa previsión le permite predecir sus futuros, ahora entrelazados. Con más misterios desarrollándose rápidamente, incluida la aparición de un barco fantasma y un alquimista con el poder de la transmutación, Victorique y Kujou, atados por el destino y sus habilidades únicas, no tienen más remedio que confiar el uno en el otro.